使用virusSeq对NGS数据分析病毒整合位点

ulwvfje — Tue, 15 Mar 2016 11:00:09 +0000

开发单位：安德森癌症研究所

功能：对NGS数据进行分析，探测已知病毒在人基因组整合情况

从fastq文件开始，需要借助MOSAIK进行比对

主程序就两个perl程序，不需要安装！

一，软件下载：

直接在官网下载下面这些文件即可！

其中，软件压缩包里面附带了说明书，数据下载后该解压的要解压，然后要根据说明书整理好文件，变成四个文件夹，放置好相应的文件。

它的说明书写的非常详细，其实我都没必要再讲下去了！

二，软件使用

其实它给了测试数据，如果测试数据运行成功，那么就没有问题了！

因为它依赖于MOSAIK，所以我才特意讲了MOSAIK，但是我感觉它们这些软件都有个不好的问题，都是需要重新比对，很麻烦！

其实现在很多主流比对软件可以达到非常高效快速了！

最后，我并没用这个软件，所以我只是提一下它，大家如果有需求，可以自己去用

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