http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/

我们这里就在window平台下使用，所以直接下载zip包即可，解压即可使用

准备数据

我这里就简单的用muscle生成了一个树文件来看看结果TRAV.fa 是一百多个类似的基因

muscle -in TRAV.fa -out tmp

muscle -maketree -in tmp  -out TRAV.tree

这个树文件TRAV.tree是Newick format,可以直接被figtree识别从而画图

软件使用

很简单，下载，点击即可使用，然后导入树文件，就可以直接出图啦!