Ensembl数据库在线网页工具biomart简单教程

ulwvfje — Tue, 31 Mar 2015 07:28:29 +0000

这个工具主要是针对不会bioperl不会API调取数据的生信纯菜鸟准备的，主要是方便大家批量研究某些感兴趣的基因，需要准备的数据就是基因名或者基因的ID号，能从该网站获取的资料非常多，可以是关于你的输入的基因名的各种数据库有的信息。

第一步：选取数据库，我一般选取人的

第二步，选择上传数据的格式

这个下拉框里面可以选取很多种格式，你随便张贴进去哪一种格式的基因ID都可以，也可以把做好的ID文件上传进去，批量获取基因信息。

我这里输入的是几个免疫基因。

第三步，选择下载数据的格式

首先可以选择你上传的gene的可以转换的各种ID

然后可以选择你上传的gene的各种序列

可以选择的信息非常多，基本上可以想到的转换在这里都能做！！！

但是，始终没有脚本方便，只适合不太懂编程的菜鸟使用！

然后点击result即可，看到结果还可以导出成txt文档，点击右上角的GO即可

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